商標糾紛案件主要有四種類型：商標行政糾紛案件，商標侵權糾紛案件，商標轉讓與商標使用許可合同糾紛案件及商標刑事糾紛案件。

1、侵犯商標專用權案件：

根據(jù)民事訴訟法的規(guī)定因侵權行為提起的訴訟，由侵權行為地或者被告住所地人民法院管轄。因此，侵犯商標專用權案件一般由侵權行為地或者被告住所地的中級人民法院或者有商標案件管轄權的基層法院管轄。侵權行為地的認定可根據(jù)《關于審理商標民事糾紛案件適用法律若干問題的解釋》第6條的規(guī)定，因侵犯注冊商標專用權行為提起的民事訴訟，由侵權行為的實施地、侵權商品的儲藏地或者查封扣押地、被告住所地人民法院管轄。其中侵權商品的儲藏地，是指大量或者經(jīng)常性儲存、隱匿侵權商品所在地;查封扣押地，是指海關、工商等行政機關依法查封、扣押侵權商品所在地。對涉及不同侵權行為實施地的多個被告提起的共同訴訟，原告可以選擇其中一個被告的侵權行為實施地人民法院管轄;僅對其中某一被告提起的訴訟，該被告侵權行為實施地的人民法院有管轄權。

2、商標合同糾紛案件：

根據(jù)《民事訴訟法》的規(guī)定，因合同糾紛提起的訴訟，由被告住所地或者合同履行地人民法院管轄。合同的雙方當事人可以在書面合同中協(xié)議選擇被告住所地、合同履行地、合同簽訂地、原告住所地、標的物所在地人民法院管轄，但不得違反本法對級別管轄和專屬管轄的規(guī)定。當事人約定的履行地與實際履行地不一致的，以實際履行地為準。因此，上述地點的中級人民法院或者有商標案件管轄權的基層人民法院有管轄權。對于合同責任與侵權責任競合的商標案件，按照當事人選擇的訴因來確定管轄法院。

3、商標權屬糾紛案件：

由被告住所地的中級人民法院或者被告住所地有商標案件管轄權的基層人民法院管轄。

4、訴前停止侵權與保全案件：

根據(jù)最高人民法院《關于訴前停止侵犯注冊商標專用權行為和保全證據(jù)適用法律問題的解釋》的條規(guī)定，訴前責令停止侵犯注冊商標專用權行為或者保全證據(jù)的申請，應當向侵權行為地或者被申請人住所地對商標案件有管轄權的人民法院提出。