1、申請主體不同。申請爭議的人只能是在先注冊的商標(biāo)所有人，而不當(dāng)注冊商標(biāo)的撤銷請求人可以為被請求撤銷商標(biāo)注冊人之外的任何人，甚至可以直接由商標(biāo)局依職權(quán)撤銷；商標(biāo)異議的請求人則為任何人。 

2、適用對象不同。被爭議的商標(biāo)和被撤銷的商標(biāo)必須是已經(jīng)注冊的商標(biāo)，而被提出異議的商標(biāo)是初步審定并公告但尚未被核準(zhǔn)注冊的商標(biāo)；商標(biāo)異議程序是商標(biāo)被核準(zhǔn)注冊的必經(jīng)程序，但對注冊商標(biāo)爭議的裁定及商標(biāo)注冊無效的補(bǔ)正不是必經(jīng)程序。 

3、法定期限不同。對已經(jīng)注冊的商標(biāo)提出爭議的時間為自被爭議的注冊商標(biāo)核準(zhǔn)注冊之日起5年內(nèi)；提出商標(biāo)異議的商標(biāo)異議的時間為自該商標(biāo)初步審定并公告之日起3個月內(nèi)；提出不當(dāng)注冊商標(biāo)的補(bǔ)正請求時間則因不同情況而有所不同。 

4、申請事由不同。注冊商標(biāo)爭議的理由，即是在后注冊的商標(biāo)與用于同一種或類似商品上在先注冊的商標(biāo)相同或近似，其理由不能與核準(zhǔn)注冊前 已提出異議并經(jīng)裁定的事由和理由相同； 提出異議的理由是，經(jīng)商標(biāo)局初步審定并公告的商標(biāo)違反了商標(biāo)法的某一規(guī)定；撤銷注冊不當(dāng)?shù)纳虡?biāo)的理由，是該注冊商標(biāo)違反了《商標(biāo)法》第10條、第11條和第12條的規(guī)定，或者是注冊申請人采用了欺騙手段或者其他不正當(dāng)手段獲得注冊，以及違反商標(biāo)法第13條、第15條、第16條和第31條規(guī)定而取得注冊的商標(biāo)。 

5、受理機(jī)關(guān)不同。爭議必須向商標(biāo)評審委員會提出，由商標(biāo)評審委員會作出裁定；異議則應(yīng)向商標(biāo)局提出，對商標(biāo)異議的裁定不服的，當(dāng)事人可 向商標(biāo)評審委員會申請復(fù)審；對注冊商標(biāo)的撤銷，既可以由商標(biāo)局依職權(quán)決定，也可以由他人請求商標(biāo)評審委員會裁定，由商標(biāo)評審委員會作出裁定，但對于由商標(biāo) 局作出的決定，商標(biāo)注冊人還可請求商標(biāo)評審委員會復(fù)審。